Vous avez toujours désiré faire basculer votre vie ? Rêvé de devenir un Pokémon ? De pouvoir évoluer en différentes formes incroyablement magiques ? De posséder toujours plus de pouvoirs et attaques phénoménaux ?

Votre rêve va enfin se réaliser : Pokémon Agency est fait pour vous. Rencontrez des milliers de pokémon différents, affrontez-les et devenez le plus puissants de tous !

Depuis que Pichu a ouvert, à l'aide d'une mystérieuse bague, une brèche entre les deux mondes : des humains traversent parfois la ligne... Transformés en Pokémons, ils doivent alors se mêler aux autres... Cependant, une fois entrée dans ce monde féerique, vous ne pouvez plus faire demi tour (mais qui le voudrez vraiment ?).

Pour vous adapter à la nouvelle vie qui s'offre à vous, vous devrez parcourir ce monde recouvert de créatures magiques, ou aucun être vivant y habitent... A part des pokémons comme vous et moi. Des quêtes surprenantes vous seront données tout au long de votre aventure pour que vous puissiez aider les pokémons en détresse. Votre équipe, vous suivra tout au long de votre voyage dans ce monde..

Et si vous voulez vraiment quitter cet univers merveilleux et redevenir ce que vous êtiez avant d'attérir ici, le Professeur Seko a crée une machine qui, selon lui, serait capable d'inverser le processus et de permettre au humains de retrouver leur forme et leur monde. Rien ne vous garantis que vous rentrerez bien chez vous, car la machine est encore en face d'expérimentation. Ce sera à vos risques et périls de l'essayer, soit elle ne fonctionne pas, et vous restez prisonnier ici.. soit vous risquez d'en sortir tout effaroucher.

Hélas, la bague mystérieuse que portait Pichu a été perdue, et elle seule peut faire fonctionner la machine...

Le mécanisme de la bague ayant cessé de fonctionner, cela crée une brèche qui permet à n'importe qui d'accéder dans ce monde féerique : enfants,adultes, et même des mauvais esprits... La présence d'humains de plus en plus nombreux est un danger pour les deux univers : Ne pouvant rejoindre leur propre monde une fois la brèche passée, les humains envahissent peu à peu le monde des Pokémons. Surpopulation chez les uns, Terre en voie de désertification, l'équilibre risque d'être rompu! Le pire est que malgré les fouilles du Professeur, et celle des Pokémons, il est impossible de retrouver la trace de la bague ! Elle se serait comme.... volatilisée ! Il est peu probable de remettre la main dessus un jour, à moins que Pichu se souvienne où elle a posée la dernière fois...

Mais est-ce qu'il ne serait déjà pas trop tard ? On remarque que le monde des Pokemons commence à être surpeuplé, car de plus en plus d'humains traversent la brèche. Ce qui serait une énorme gêne pour les pokémons habitant de Bourg-Trésor, leur existence était censé être secrète et cachée aux humains. Afin que justement le monde entier ne sache pas qu'en dessous de notre planète, il existe bien un autre univers.

Que va devenir la Terre dans cinq ans ? Comment vont survivre les nouveaux pokémons dans ce nouvel univers étrange ? Est-ce que le surpeuplement du monde magique ne met pas en danger les pokémons ? Serez-vous celui qui permettra de retrouver cette bague? Aurez-vous le courage d'essayer la machine et de sauver les deux univers?