Il y a quelques milliers d’années, une terrible guerre faisait rage entre deux puissantes villes-machine, Zanarkand et Bevelle. Au paroxysme de ce conflit, une entité dévastatrice du nom de Sin fit son apparition et réduisit Zanarkand à néant pour punir les hommes de leur vanité. Effrayés par cette menace inattendue, les habitants du reste de Spira se réunirent autour de la religion. Ainsi naquit Yevon, le culte de la culpabilité. Depuis depuis quelques centaines d’années, des Invokeurs se succèdent pour effectuer un pèlerinage ayant pour but d'anéantir Sin... mais seulement pour une courte durée : la Félicité. Peu de Félicités ont été apportées jusqu‘à présent. Les dernières en date sont celle de Braska, il y a 30 ans. Mais un dizaine d’année plus tard il a refait surface, Sin était de retour. Et c'est sa fille, Yuna, qui se décida d’offrir au reste de Spira une période de calme, espérant que cette fois-ci sera la dernière : l'éternelle Félicité. Accompagnée de ses gardiens, Tidus, Kimahri, Lulu, Wakka et Auron, Yuna suit les traces des précédent invokeurs et plus précisément les traces du grand invokeur Braska, père de yuna, et des ses deux gardien : Auron et Jecht. Elle réussit à vaincre Sin. Malheureusement avec cette victoire, elle entraîna également la disparition de toutes les créatures liées au rêve qui préservait l'ancienne Zanarkand : les Priants, les Chimères... mais aussi Tidus, qui n'était en fait qu'un envoyé des Priants. Yuna, désespérée, dut accepter l'inacceptable : perdre celui qui était devenu à ses yeux bien plus qu'un simple gardien. Finalement

Beaucoup de choses ont changé à Spira. L’éternelle Félicité apportée par Yuna et ses gardiens n'a cependant pas entraîné que du bonheur : les préceptes religieux de Yevon ont perdu toute crédibilité, les machines des Al Bheds ont envahi la société. Et plus important encore, les hommes ont dû chercher un nouveau sens à leur existence : les anciens Bannisseurs, par exemple, dont la seule raison d'être était de combattre Sin ; les prêtres de Yevon, aussi, dont l'église s'est brutalement effondrée ; et peut-être plus que tout autre les Invokeurs qui, comme Yuna, se sont vus contraints de chercher de nouveaux objectifs à leur vie. Ironiquement, la disparition de Sin a entraîné plus de bouleversements que de soulagement pour Spira...Des tensions commencent à naître entre les partisans des machines al bhedes, qui cherchent à rebâtir immédiatement un monde technologique, et les conservateurs, qui appliquent le fameux adage "chaque chose en son temps". Une dizaines d’années plus tard, Zarnakand était reconstruite, par les invokeurs en général. Mais il ne fût pas longtemps pour que les vieilles rancunes de passé, entre Zarnakand et Bevelle resurgissent. Yevon n’existe plus que dans des souvenirs lointains, mais le passé rattrape bien vite Spira. Le peuple aurait il déjà oublié le passé obscure de leur ancêtre ?
Alors, que Bevelle déclare la guerre à Zarnakand, des bêtes surgissent de nulle part attaquant et effrayant toute la population. Bientôt des rumeurs courraient que Yunalesca, la fille de Yevon avait été aperçut près de Zarnakand, ou bien que Yevon lui-même était de retour. D’un côté : la population qui ne croyait que très peu en ses rumeurs, et continuèrent le mouvement, d’un côté les nouveaux invokeurs de Zarnakand, de l’autre les machines de Bevelle. De l’autre: la population effrayée et lucide qui implorait la paix, pensant que Spira pourrait bien replonger une nouvelle fois dans les ténèbres. Au fur et à mesure, les monstre devenaient de plus en plus féroces et puissant, des « apparitions » de défunts puissant tel que Seymour, Maître Jyscal Guado, Jecht ou encore des anciens invokeurs devenait de plus en plus courante. La population vivait à nouveau dans la peur, mais il était bien trop tard pour faire marche arrière. Plus inquiètant encore, Zaon, autrefois transformé en chimère par Yunalesca, sa femme, n’aurait pas « disparut » complètement. Il se nourrirai de la haine des gens pour vivre, il acquit petit à petit un pouvoir énorme : le souffle de vie. Le souffle de vie pouvait réveiller du sommeil éternel n’importe quel défunt. Seulement il lui fallait récolter énormément de haine. Après quelques temps, il ressuscite d’abord sa bien aimé Yunalesca. Yunalesca ne tarda pas à aller réclamer son dût : le trône qui lui appartenait selon elle, l’héritière de Zarnakand. Les invokeurs ne purent lui refuser, la soif de pouvoir été de plus en plus présent dans le cœur de chaque invokeurs, et chacun savait que la fille de Yevon pourrait leur apporter la victoire face à Bevelle.
Il ne fallut pas plus de d’un mois pour que Spira plonge dans l’obscurité la plus complète.